套利交易与套期保值交易有相近之处，两者都建立了两个相反的交易部位，在对冲之后以一个交易部位的盈利来弥补另一个交易部位的亏损。但是套利交易与套期保值交易有着根本的区别。
主要表现在以下四个方面：
1.目的不同
套利作为一种投机的方式，其交易的主要目的是从金融工具的买卖中获取利润。而套期保值的目的是风险规避，从事期货交易是为了转移风险。
2.基础不同
套期保值者一般是在现货市场上持有头寸，或者预期将持有头寸，因而在期货市场上建立反向的期货头寸，防止因价格的变化而影响正常的营业利润，而套利没有商业经营作为基础，其所持有的现货头寸和期货头寸都是套利交易的一部分，从这些头寸的价格差异中获利。
3.涉及的市场范围不同
套期保值只涉及股票现货市场与期货市场这两个市场；而在套利中，对股票现货市场与期货市场之间价格差异进行的交易只是套利的一种形式，套利交易还可以在股指期货市场与远期市场之间、不同的股指期货市场之间进行等等。
4.依据不同
套期保值依据的是假定股票现货和期货价格大体同步变动；而套利利用的正是股票现货与期货价格不一致进行获利的。因此股票现货市场间的套利效益对于套期保值成功地减少风险是非常重要的。
